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青藏高原溪流微生物海拔分布格局和驱动机制数据集

 

该数据集由王建军团队提供,包含2018年8月3日至2018年8月4日的西藏墨脱溪流生物膜和2019年7月12日至2019年7月22日的西藏东南部溪流生物膜样品数据。(1)墨脱县位于西藏东南部林芝市,地处雅鲁藏布江下游,采样点的经纬度为29°23'44.25"N-29°44'28.89"N,95°22'54.57"E- 95°41'10.34"E,海拔909-3553m,共采集198个样品,探究溪流微生物海拔分布格局和驱动机制。(2)2019年7月通过对入江溪流的河网调研和河网野外采样,获取“云南-西藏”沿线河网水样及生物样品,样品数为34个,经纬度为25°83′-30°16′N, 96°66′-98°09′E,海拔990-4600m。采用高通量分子生物学等方法获取微生物群落数据,揭示河网生物资源的海拔分布格局和驱动因素。采样搜集了各个采样点的环境指标和地理信息,测定了水体理化参数和营养盐;同时获取水样及生物样品。

发布的数据包括:环境数据和微生物群落数据。环境数据包括,日期/时间,经度、纬度,海拔(m),河流的宽度(m)、pH,电导率(μS/cm),总氮(mg/g)和总磷(g/kg)。微生物群落数据为细菌16S rRNA基因和真菌ITS2基因高通量测序分析所得。细菌16S rRNA基因选用V4高变区通用引物515F (5'-GTG YCA GCM GCC GCG GTA-3')和806R (5’ -GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’),真菌ITS2基因选用通用引物gITS7F (5’- GTGARTCATCGARTCTTTG-3’)和ITS4R (5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’)进行了PCR扩增,PCR扩增产物经胶纯化、定量后用Illumina Hiseq平台测序。

详细信息参见泛第三极环境数据中心:http://tp.lzu.edu.cn/node/dataSet/dataSet01.jsp