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藏东南地区水体和沉积物细菌群落分布特征数据集

 

该数据集由中科院土壤所褚海燕研究员团队提供,包含2019年7月13日至7月25日沿藏东南河流湿地采集的表层水体和表层沉积物样品数据,共12个采样地点,包括怒江、澜沧江、金沙江、然乌湖、让舍曲、嘎达曲,桑曲等,每个采样位点分别随机采集6份水体和表层沉积物样品,共得到204份水体和表层沉积物样品。 采样区域经纬度范围为28°03′33″N到 29°46′35″N和 96°42′32″E 到 99°23′32″E,海拔范围800到4600m。

对样品进行总DNA提取,具体操作流程按照操作说明书完成(FastDNA® SPIN Kit for soil, MP Biomedicals, Santa Ana, CA)。细菌测序 引 物 为 515F ( 5'−GTGCCAGCMGCCGCGGTAA−3' ) 和 907R(5'−CCGTCAATTCCTTTG AGTTT−3')。测序平台为Illumina MiSeq PE300 (美吉公司)。

上传的数据包括:样品编号,样品名称,样品标题,实验编号(hychuE1);采样时间,采样位置,经纬度坐标,样品类型,样品照片,照片存放路径,测序目标,测序片段,测序引物,测序平台,数据格式,数据以序列文件数据格式正向 *.1.fq和反向 *.2.fq储存。

详细信息参见泛第三极环境数据中心:http://tp.lzu.edu.cn/node/dataSet/dataSet01.jsp