2023年12月29日,应兰州大学泛第三极环境中心邀请,中山大学医学院施莽教授进行了题为“人工智能方法重新定义RNA病毒圈”的专题讲座。讲座由刘鹏飞教授主持,采用线下线上结合的方式进行。
施莽教授从两个方面进行了汇报:(1)基于生命组学方法新病毒发现;(2)人工智能方法重新定义RNA病毒圈。
动物是探究人类病毒的起源,施莽教授团队通过鉴定多种“野味动物”携带的病毒,发现了71种哺乳动物病毒,涉及13个病毒科,其中包括野生动物特有病毒、人类病毒(乙型流感、诺如病毒、人副流感病毒)、人兽共患病原H9N2、HEV、轮状病毒等等。此外,施莽教授团队采集了23个省份的50000+蚊虫样本,发现蚊虫病毒组的多样性和宿主和降水呈正相关,和地域的平均温度呈负相关;同时,蚊虫宿主特异性表现出从泛化(Generalist)到特化(Specialist)的连续体。此外,施莽教授团队也对极地的环境样本和动物样本的病毒组进行了探究,在南极底泥中发现了超过1500种病毒。
基于生物信息学的方法进行的同源性的病毒鉴定流程存在过程复杂、速度慢等特点,为了解决这一不足,施莽教授团队引入AI作为辅助进行病毒鉴定,并进行了验证。基于的数据是来自于SRA数据库的全球10487份宏转录组样本,通过定义AI能够理解的问题,对RNA病毒的多样性进行了补充,同时利用BLAST等方法对新发现的病毒进行了验证。
该报告引起了老师和同学们的浓厚兴趣,参会师生们与施莽教授展开了积极的学术交流和激烈的思维碰撞。会议在中心师生们的热烈掌声中圆满结束。